Rex doit empêcher Van Kleiss et ses sbires de gagner des pouvoirs sans précédent qui pourraient détruire la Terre. Multi-Head, Biowulf et le Cœur d'Aquania apparaissent dans le jeu en tant que méchants de soutien. Lorsque Rex part en mission pour vaincre l'EVO Multi-Headed, il découvre un morceau d'un schéma qui est ensuite volé par Breach. Cela cause à Rex de perdre certaines de ses nouvelles constructions. Il signale cet événement à Providence et se rend dans la jungle. Un morceau du schéma est situé dans le laboratoire du Dr Rylander, où Rex copie les données de Rylander. Il est ensuite rapidement attaqué par l'EVO "Lapin", qu'il parvient à vaincre. Breach vole à nouveau le schéma, alors que Rex retourne à Providence. Ensuite, Rex se rend à Hong Kong avec Bobo Haha pour empêcher Quarry (l'ancien patron de Rex) de voler des objets, y compris un morceau du schéma. À l'intérêt de Rex, il rencontre son amour romantique, Circe. Il découvre qu'elle travaille à nouveau pour Van Kleiss, car il l'a aidée à s'échapper de lui.
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Activision
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